厦门大学附属厦门眼科中心专业设置齐全，有白内障、眼屈光、青光眼、眼底病(玻璃体视网膜病)、斜弱视及小儿眼科、眼表与角膜病、眼整形、眼外伤、高度近视等九个亚专科，并设有医学验光配镜部和临床医技检查部（检验科、特检部、放射科、内科），掌握了国内外眼科核心技术，能开展涵盖了眼科病种的临床诊治。轮转科室为九个亚专科+门诊+特检部+医学验光+协同厦门第一医院（神经内科、内分沁、急诊）